En 2003 Peyton empató con el ya retirado Steve McNair como el Jugador Más Valioso (MVP) de la NFL. El mariscal de los Potros sumó esa temporada 4,267 yardas y completó 379 pases de 566 con 6 para anotación.

Pero al año siguiente, el premio fue solo para Manning en una temporada que aunque en pases no superó su marca anterior, en yardas sumó 290 más.

Después de coronarse en 2007 en el Super Bowl XLI con los Potros, Peyton se ganó el MVP de 2008 y 2009, está última una de sus mejores en cuanto a números con 393 pases completados.