En septiembre, recién declarado presidente electo, Peña Nieto entregó a los legisladores del PRI una iniciativa de reforma para ampliar las facultades del Instituto Federal de Acceso a la Información y Protección de Datos (IFAI), el principal órgano de transparencia del país.

La propuesta fue discutida durante cuatro meses en el Senado, hasta que el 20 de diciembre fue aprobada y enviada a la Cámara de Diputados para su revisión, que se llevará a cabo en 2013.

El documento, sin embargo, fue modificado respecto del que Peña Nieto había entregado al Poder Legislativo. Tras varias semanas de negociaciones con el PRI, el PAN y el PRD lograron que a la iniciativa se integraran propuestas de sus senadores —la panista Laura Rojas y el perredista Alejandro Encinas—, a fin de cambiar el método de selección de los comisionados del IFAI.

Peña Nieto propuso que el número de comisionados del IFAI aumente de cinco a siete, pero quería mantener el actual mecanismo de elección, es decir, que sean nombrados por el presidente y ratificados por el Senado. Al final, con acuerdo del PRI, el PAN y el PRD consiguieron que sea el Senado el que inicie el proceso de designación, emitiendo una convocatoria a la ciudadanía y escogiendo candidatos que podrían ser objetados por el presidente hasta en dos ocasiones. Panistas y perredistas afirman que ese procedimiento garantiza que los nuevos comisionados gocen de independencia.